医药相结合，医药不分家，这是瑶医药最主要的特色。行医者必识药，采药者必懂医；行医而不识药则医不灵，采药而不懂医则药无效。因此，瑶医过去和现在都是自己诊病，自己采药加工，配方发药，从来没有医药分家的现象。

瑶族用药，基本上采用瑶山盛产的草药及动物药，药物以鲜用及饮片为主，部分经特殊炮制后使用。瑶山独特的药材历史极其悠久，名声甚著，药效颇高。瑶医用药品种总计达千余种，每个瑶医（门诊部、诊所、药摊）掌握并经常使用的品种一般在200～300种。各族系瑶医所用品种及名称并不完全一致，但在实践中根据药物的性味功能及治疾病的特点总结出的独具一格的“五虎”、“九牛”、“十八钻”、“七十二风”等104种药物，则在大多数瑶家的用药实践中广为流传。他们把一部分药物称为老班药（即前辈祖传之意），这对瑶医临床用药有着十分重要的意义。

瑶医对药物的命名形象生动，通俗易懂。有些药物以药物形态来命名，如鹰爪风、鹞鹰风是指该植物花或刺形状如鹰之爪；间奶果即该植物的果实状似羊之奶等。有些药物以药效来命名，如一身保暖、十全大补，顾名思义，它们属于滋补类药物；而麻骨风、半枫荷，则是风湿痹痛、跌打损伤的治疗药；有的是以生长环境取名，如上山虎、守山虎、下山虎等等。这样命名不仅给采药人员提供了极大的方便，而且还有利于瑶药的推广及传播。

瑶医的处方简而精，用药灵活，用药理论独特。例如，瑶医常以动物之间的相克关系来指导用药，如观察到猫能捉老鼠，就用猫骨配他药治疗老鼠疮（即淋巴结核）；狗怕老虎，就用虎骨配他药来治疗狂犬病；蜈蚣怕公鸡，就以公鸡的唾液来治疗蜈蚣咬伤等等。在瑶医治病配方中类似的例子很多，他们把深奥的医学科学原理形象化，并与生活结合起来，以便记忆、传授及使用。

在药物制剂方面，瑶医常用的有煎剂、内服膏剂、散剂、药汁、丸剂、酒剂、鲜药捣汁内服、鲜药含服、搽剂、外敷剂、滴耳（眼）剂、烟熏剂、熏洗剂、沐浴剂、食疗剂、佩挂剂等等应用形式，这说明了瑶医在药学方面已具有很高的造诣。

此外，瑶医还擅长于多种疗法的综合运用，疗效显著确凿，疗程亦短。由于居处深山老林，海拔高，气候寒冷潮湿，风湿痹痛、痧、瘴、蛊、毒等为常见病、多发病，瑶医对这些病症的治疗，以草药内服、外敷、外洗为主，配合药浴、拔罐、药垫、火攻、杉刺、陶针、针挑、刮痧、挟捏、蛋灸、艾灸、油火灯灸等多种方法进行综合治疗，往往取效迅捷。